フルスクリーン化しつつAdlib Tracker IIとMIDIアプリを同時に立ち上げる 
いけましたいけました！ 全画面！
VBEIというコマンドラインツールを使います。
vbei_112.zipをダウンロードして、その中のvbei.exeをat2_up.jsと同じフォルダに置きます。
そして、at2_up.jsをテキストエディタで開いて42行目を以下のように修正します。
var at2App = wso.Exec("cmd /c title " + winTitle + " & us & " + aioPath + " " + at2Path + " " + at2Port);
↓
var at2App = wso.Exec("cmd /c title " + winTitle + " & us & vbei & " + aioPath + " " + at2Path + " " + at2Port);
これでおｋ！
なんだーちくしょう。adtrack2.iniのscreen_modeを「1」とか「2」にしても一瞬だけフルスクリーンになってすぐに落ちるだけだったので、ntvdmはそういうもんなんだと思ってました……。
このツールの作者の方に感謝！
これで煩わしい作業は一切無くなりました。
Let’s OPL3!!
追記。
上記の修正を施したファイルをうｐしました。ついでに色々スリム化。
Adlib Tracker II 起動スクリプト rev2